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使用SoloVPE可变光程技术测定蛋白质的摩尔消光系数

浏览: 时间:2024-04-17


介绍

本文节选自University of Wisconsin生物化学系Darrell R. McCaslin的应用简报。

光谱法有多种形式,它是生物分子结构和功能表征的重要工具。吸收光谱法是最简单也是最为人所熟悉,它通过直接和间接方法对生物分子进行定量。其中,间接分析方法是很常见的,它利用各种化学反应来提供通过光谱定量的信号。这些方法通常需要构建标准曲线,而且标准物质的化学反应要准确对应目标分子的数量。如果目标分子的消光系数已知,那么通过吸光度读数直接得出浓度,无需使用任何标准物质这篇应用简报里,作者描述了使用solovpe可变光程技术和斜率光谱法测定含有色氨酸和酪氨酸的蛋白质摩尔消光系数的方法


SoloVPE简介

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SoloVPE与Cary60分光光度计配合使用。Cary60从传输光缆的一端提供光源,传输光缆的另一端连接到SoloVPE中的光纤平台。在平台上,光被传送到“小光纤”(Fibrette)的一端,小光纤通过光纤耦合器连接到光纤平台,光纤的另一端浸入位于光纤平台下方的比色皿中的样品溶液里。从这个浸没的光纤端面射出的光,通过样品进入比色皿下方的检测器。

SoloVPE的光程L是小光纤浸没的端面到比色皿内表面底部的距离。浸没深度由光纤平台的位置控制,光纤平台通过光纤耦合器连接到光纤平台上。光纤平台的垂直位置由软件驱动的步进马达决定;从而在样品中可以精确改变光纤端面的位置。
光谱法定量的理论基础是朗勃比尔定律:
Beer‘s Law   A = e L c 

式中,A是溶液的吸光度,L是光程,c是溶液浓度,e是样品分子的本身特性,即摩尔消光系数,其单位是c和L乘积的倒数。公式中A对于c和L都是线性的,线性偏差可能是由于仪器本身或溶液中分子性质随c的增加而发生变化导致的。SoloVPE允许使用单个样品在多个光程下快速测量完整光谱;从中我们可以构建一个吸光度与光程长度的“斜线”。剖面图中的斜率(m)为e*c,因此可以通过其中一个对另一个进行计算:

m = d(A)/d(L) = e c

斜率法测量提供了在单个光程上不能获得的更多信息,提高了结果的精度。此外如果浓度在仪器的比尔定律线性区域内(对于单抗药物,范围0.05-300 mg/mL),还可以省去稀释步骤。


浓度与斜率的关系
如果缓冲液的吸光度随着光程的变化,没有显著函数变化,那么可以不需要进行背景校正,测量的缓冲液吸光度将被仪器基线抵消。下图右显示的是从基线校正和未校正的光谱剖面图中提取的。可以看到,截距大小与两组的浓度无关。这表明在这种情况下不需要做缓冲液背景校正,即缓冲液没有显著的依赖于光程的吸光度。

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SoloVPE测定蛋白质的摩尔消光系数
对于浓度的定量,摩尔消光系数必须是已知的。如果样品可以被准确称重,就可以使用斜率光谱法测量摩尔消光系数。对于大多数生物制品来说,干重不容易测量。对于蛋白质而言,在280 nm处对吸光度起主要作用的是色氨酸(W)和酪氨酸(Y)残基,以及二硫键(CC)的贡献。一般来说,我们会知道蛋白质的完整序列,尽管二硫键模式也许不能被完全表征,但是我们对每个多肽链的吸光度的主要影响因素有一个准确的评估。此外,大多数蛋白质在6 mol/L盐酸胍(GuHCI)中完全变性,因此可以近似消除蛋白质折叠产生的影响。Edelhoch("Spectroscopic determination of tryptophan and tyrosine in proteins", Biochemistry 6: 1948-1954)开发了一种方法,通过测定6 mol/L GuHCI溶液中蛋白质的W、Y和CC的含量来计算蛋白质的摩尔消光系数。在这里,这种方法与SoloVPE的斜率光谱法相结合,对于给定的一种蛋白质溶液,稀释到相同体积的缓冲液或盐酸胍溶液中,在两种溶液中测得的斜率之比就是它们的摩尔消光系数之比:


mwater/mGuHCI ewater[P]/eGuHCI[P] =  ewater/eGuHCI

以BSA为例,W=2,Y=20,CC=17,根据Pace, C. N., et al. (1995). "How to measure and predict the molar extinction coefficient of a protein." Protein Science 4: 2411-2423文章中的推导公式,计算在6 mol/L GuHCL中蛋白质的摩尔消光系数eGuHCI = W*5685+Y*1285+CC*125。如果准确地将样品稀释成GuHCI溶液,并确定剖面图的斜率,则该摩尔消光系数可用于计算浓度。本研究中使用的商业材料的报告浓度为275 mg/mL。使用280 nm截面图的斜率,将50 uL的样品稀释到5.05 mL,并计算在6 mol/L GuHCL中蛋白质的摩尔消光系数e(GuHCL)(3.9 x 104/M/cm,见下表),计算出浓度值为299 mg/mL,浓度高了约8%。


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在计算了eGuHCI并测量了蛋白质在水中和6 mol/L GuHCL中的斜率值,计算ewater就简单了。

mwater/mGuHCI eGuHCI =  ewater

SoloVPE在不同的光谱波长区域允许不同的光程长度增量。因此,可以在具有不同摩尔消光系数的波长范围内(例如紫外区域和远紫外区域)一次性创建良好的斜率图。使用这种方法,只需一个样品就可以完成摩尔消光系数的测定。

m220/m280e280 = e220

结合精确的浓度测量,通过精确的称重,或蛋白质的氨基酸定量分析,SoloVPE还提供了一种简单、直接的方法来确定摩尔消光系数。上面描述的方法,是在未知浓度的情况下,测量出了蛋白质的摩尔消光系数。这些数据还可以用来构建完整的摩尔消光系数谱系。SoloVPE的可改变光程技术和斜率值提供了丰富的信息,与单点固定光程的测量相比,减少了误差。

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